Tam kde dříve stála ranně gotická tvrz, tam dnes stojí gotický hrad který byl zbudován v 15. století Vilémem z Pernštejna.Později se majitelem hradu stal Ferdinand I.Ten jej však roku 1562 prodal pánům z Jindřichova Hradce a ti ho poté přestavěli na renesanční zámek.O sto let později celé panství koupil Jan Adolf I. z rodu Schwarzenberků.Ti zde poté sídlili po další tři století.Na popud Adama Františka byl zámek v 18. století zrekonstruován v barokním slohu.V první polovině 19. století se Jan Adolf II. rozhodl že nechá zámek Hlubokou strhnout a nechal od základů vybudovat nový zámek v romantickém stylu.Projektové plány vypracoval a stavbu poté dvacet let řídil architekt Franz Beer.
Budovy komplexu který stojí dnes, byly vybudovány stylem tudorovské gotiky inspirované královským zámkem Windsdor.Velmi náročné interiéry i exteriéry byly nakonec dodělány až roku 1871 a to pod vedením D. Deworetzkého.Zámek je ze všech stran obklopen parkem anglického stylu a nechybí ani sochařská výzdoba.
